Axe 2: Oomycètes

Oomycètes

Les oomycètes contournent rapidement les résistances génétiques déployées au champ, habituellement conférées par des gènes majeurs de résistance. La résistance polygénique, qui exerce une pression de sélection plus faible sur les cibles génétiques du pathogène, et en exploitant des résistances d’origines géographiques différentes pourrait ralentir ou gêner la capacité du pathogène à s'adapter à ces combinaisons.

Nous identifions et caractérisons les facteurs quantitatifs végétaux dans les plantes (tomate et poivron) et identifions les facteurs d'agressivité chez deux de leurs principaux pathogènes oomycètes (Phytophthora infestans et P. capsici, respectivement):

  • en explorant la diversité naturelle des cultures maraîchères et des espèces sauvages apparentées
  • en explorant la diversité au sein des pathogènes des zones géographiques cultivées et non cultivées
  • en étudiant les interactions entre plantes et oomycètes et en décryptant la résistance partielle au niveau moléculaire
  • en évaluant la robustesse de ces résistances face aux variations environnementales (biotiques et abiotiques)
  • en développant de nouveaux génotypes associant des allèles de résistance polygénique et en évaluant leur efficacité face aux oomycètes       

Publications représentatives

Caromel B, Hamers C, Touhami N, Renaudineau A, Bachellez A, Massire A, Damidaux R, Lefebvre V (2015). Screening tomato germplasm for resistance to late blight.  INNOHORT, Innovation in Integrated & Organic Horticulture. ISHS International Symposium, Avignon (France), 8-12 June 2015, pp 15-16

Mallard et al. (2013). A key QTL cluster is conserved among accessions and exhibits broad-spectrum resistance to Phytophthora capsici: a valuable locus for pepper breeding. Mol Breeding 32(2):349-364

Nicolaï et al. (2013). Genotyping a large collection of pepper (Capsicum spp.) with SSR loci brings new evidence for the wild origin of cultivated C. annuum and the structuring of genetic diversity by human selection of cultivar types. Genet Resour Crop Ev 60:2375-2390

Thabuis et al. (2003). Comparative mapping of Phytophthora resistance loci in pepper germplasm: evidence for conserved resistance loci across Solanaceae and for a large genetic diversity. Theor Appl Genet 106(8):1473-1485

Contact

Véronique Lefèbvre <veronique.lefebvre@inrae.fr>

Emmanuel Szadkowski <Emmanuel.szadkowski@inrae.fr>