ArchiGenet PLAN ALLIANCE

L’utilisation de variétés résistantes constitue un levier efficace et durable pour lutter contre les maladies des plantes. Néanmoins, les systèmes agricoles modernes sont régulièrement confrontés à des contournements de résistances menaçant la sécurité alimentaire. À l’inverse, les écosystèmes naturels limitent les épidémies grâce à une forte hétérogénéité génétique des hôtes. Des stratégies telles que le pyramidage génique, les mélanges ou les rotations variétales visent à reproduire cette diversité en exploitant les coûts d’adaptation des agents pathogènes. Leur mise en œuvre nécessite de décrypter l’architecture génétique des interactions plantes–agents pathogènes, c’est-à-dire l’ensemble des QTL impliqués et leurs interactions épistatiques, qui traduisent les coûts d’adaptation des pathogènes à différents génotypes de plantes. Malgré les progrès du séquençage haut débit, ces architectures restent très peu étudiées. Ce projet vise à les caractériser dans le pathosystème melon–watermelon mosaic virus (WMV) grâce à des approches innovantes de co-GWAS expérimentale et naturelle. Les résultats permettront d’identifier de nouveaux gènes de résistance et d’alimenter des modèles prédictifs afin d’optimiser les stratégies de déploiement des résistances pour une gestion durable des maladies.