Exploration des ressources génétiques mondiales du piment

McLeod L., Barchi L., Tumino G., Tripodi P., Salinier J., Gros C., Boyaci H. F., Ozalp R., Borovsky Y., Schafleitner R., Barchenger D., Finkers R., Brouwer M., Stein N., Rabanus-Wallace M.T., Giuliano G., Voorrips R., Paran I., Lefebvre V. (2023). Multi‐environment association study highlights candidate genes for robust agronomic quantitative trait loci in a novel worldwide Capsicum core collection. The Plant Journal 116 (5):1508-1528, Manuscript accepted: 04 August 2023, DOI: 10.1111/tpj.16425

L’exploration des ressources génétiques mondiales du piment a révélé des gènes déterminant des traits agronomiques robustes dans des environnements agricoles contrastés : cibles prométeuses pour s’adapter au dérèglement climatique

En utilisant la collection mondiale du projet européen G2P-SOL de 10 038 accessions de Capsicum sauvages et cultivés provenant de 10 banques de gènes internationales, nous avons construit une core collection de 423 accessions représentant la diversité génétique connue. Étant donné que les caractères complexes dépendent souvent des interactions génotype-environnement (GxE), des analyses d'association pangénomique multi-environnementales avec une matrice génotypique de 10 195 marqueurs ont été réalisées sur 350 accessions de C. annuum, phénotypées dans six essais indépendants réalisés dans cinq pays aux climats contrastés. Des QTL (Quantitative Trait Loci) spécifiques à chaque environnement ou communs à plusieurs environnements ont été détectés pour 23 caractères agronomiques. Nous avons identifié 97 gènes candidats potentiellement impliqués dans 53 des QTL les plus robustes et les plus fiables pour la saveur, la couleur, la taille et la forme des fruits, ainsi que pour la productivité, la vigueur et la précocité des plantes. Cette étude d'architecture génétique des caractères agronomiques facilitera la création variétale.

Plant journal VL 2

 

Date de modification : 14 décembre 2023 | Date de création : 12 décembre 2023 | Rédaction : SLP