QTL contrôlant la résistance du concombre au CABYV et au CMV en plein champ et l'attractivité de leur vecteur Aphis gossypii

Horticulture Research 2025, https://doi.org/10.1093/hr/uhaf016

La cartographie de QTL pour la résistance aux virus des légumes a principalement été réalisée après inoculation mécanique dans des environnements contrôlés. En outre, les virus qui ne peuvent pas être inoculés mécaniquement, comme le CABYV (cucurbit aphid-borne yellows virus), ont été négligés dans les études sur la résistance.

Nous avons cherché à identifier des QTLs réduisant les épidémies de deux virus prévalents du concombre : CABYV et le virus de la mosaïque du concombre (CMV). Nous avons évalué la résistance de 256 lignées élites de concombre et de landraces dans des conditions de culture en plein champ en recherchant la présence des deux virus six fois au cours de la saison. Nous avons cartographié douze QTLs réduisant les épidémies de CABYV et sept QTLs réduisant les épidémies de CMV en combinant des études d'association (GWAS) et des analyses d'approche de score local. Nous avons également examiné l'attractivité de ce panel de concombres pour Aphis gossypii, un vecteur majeur du virus du concombre. Nous avons identifié cinq QTLs qui réduisent l'attractivité des pucerons, y compris un QTL co-localisé avec un QTL réduisant les épidémies de CABYV. Il est intéressant de noter que certaines accessions jugées résistantes au CMV après inoculation mécanique dans des environnements contrôlés ont montré des taux d'infection élevés dans les conditions de culture en plein champ. Les résultats de l'étude du déséquilibre de liaison local suggèrent que certains QTLs réduisant les épidémies ont été introduits tôt dans les lignées élites par sérendipité ou par sélection. Les QTL pourraient être pyramidés avec d'autres QTL à faible effet par le biais de la sélection génomique afin d'obtenir des cultivars de concombre présentant une meilleure résistance aux virus sur le terrain.