TAMISIER Lucie

Thématique de Recherche :

L’utilisation de variétés de plantes porteuses de gènes majeurs de résistance a longtemps été une solution privilégiée pour lutter contre les maladies des plantes. Cependant, la capacité des agents pathogènes à s’adapter à ces variétés après seulement quelques années de culture rend nécessaire la recherche de résistances à la fois efficaces et durables. Les résistances quantitatives et la tolérance sont supposées plus durables que les gènes majeurs, mais les preuves expérimentales sont encore rares.

Afin d’explorer le potentiel de ces ressources génétiques, notre objectif est de mesurer la capacité d’adaptation de virus des plantes à ces résistances quantitatives et tolérances, en utilisant les pathosystèmes piment (Capisum annuum) - Potato virus Y (PVY; genre Potyvirus, famille Potyviridae) et piment - Phytophthora capsici (Oomycète). Dans un premier temps, nous avons réalisé un génotypage par capture de gènes dans une descendance haploïde doublée et une core-collection de piment. Ces données permettront de réaliser de la cartographie de QTL et de la génétique d’association afin d’identifier des QTL de résistance partielle et de tolérance. Nous mettons ensuite différentes approches expérimentales en œuvre (évolution expérimentale pour les deux pathosystèmes, cartographie de QTL dans des populations virales biparentales et génétique d’association dans des core-collections virales) dans le but d’identifier des gènes et mutations dans les génomes viraux impliqués dans leur adaptation aux résistances quantitatives et tolérances.

Au-delà du contrôle génétique des maladies, ce projet permettra d’approfondir nos connaissances de l’architecture génétique des caractères du pouvoir pathogène quantitatif des virus en interaction avec les gènes de résistance et de tolérance de la plante, afin de mieux comprendre l’évolution et l’émergence des virus.

Mes travaux de recherche sont financés par le projet ANR ArchiV :

/Partenariats-et-projets/Projets-nationaux/ARCHIV-ANR-18-CE32-0004

 Formation et Carrière :

2021 - aujourd’hui : Post-doctorat à l’INRAE d’Avignon, Unités GAFL et Pathologie Végétale. Véronique Lefebvre et Benoit Moury

Architecture génétique des caractères quantitatifs dans les interactions plante-virus et plante-oomycète

2018 - 2020 : Post-doctorat à l’université de Gembloux Agro-Bio Tech (Belgique). Sébastien Massart

Projet 1 : Exploration de la diversité génétique intra-hôte des virus via l’évolution expérimentale du BYDV

Projet 2 : Le “Plant Health Bioinformatic Network” (PHBN): un projet visant à construire une communauté de bio-informaticiens et biologistes travaillant dans le domaine de la phytopathologie

2014 - 2017 : Thèse à l’INRAE d’Avignon, Unités GAFL et Pathologie Végétale. Alain Palloix et Benoit Moury

Adaptation des populations virales aux résistances variétales et exploitation des ressources génétiques des plantes pour contrôler cette adaptation

 2013 - 2014 : Master 2 Biologie Evolutive et Ecologie, Université Montpellier 2

Stage M2 : Impact des communautés bactériennes sur le succès d'invasion de la souris domestique au Sénégal, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP) de Montpellier

 2012-2013 : Master 1 Science de la Vie et de la Santé, Spécialité Biologie et Santé de l'Environnement, Université Nice Sophia Antipolis

Stage M1 : Effet de la consanguinité chez l'auxiliaire des cultures Allotropa burrelli, INRAE de Sophia Antipolis

2009-2012 : Licence Science de la Vie et de la Santé, Spécialité Biologie des Organismes et des Ecosystèmes, Université Nice Sophia Antipolis

Communications scientifiques :

2021 Experimental evolution of a plant RNA virus: a warning about spurious correlations when studying fitness changes. 18e Rencontres de Virologie Végétale, Aussois, France. Communication orale.

2019 Semi-artificial datasets as a resource for validation of bioinformatics pipelines for plant virus detection. International Advances In Plant Virology, conférence en ligne. Poster.

2019 Impact of host plants succession on Barley yellow dwarf virus population genetics. International Advances in Plant Virology, Roma, Italy. Poster.

2019 Experimental evolution of Barley yellow dwarf virus in cultivated and wild Poaceae species. 17e Rencontres de Virologie Végétale, Aussois, France. Communication orale.

2018 Impact of genetic drift, selection and viral accumulation on the evolution of an RNA virus within the plant. Journée « Modélisation de l'adaptation en environnement hétérogène » (MEDIA), Avignon, France. Communication orale.

2017 Impact of selection, genetic drift and viral accumulation on the evolution of a plant RNA virus. 16e Rencontres de Virologie Végétale, Aussois, France. Communication orale.

2016 Quantitative trait loci in pepper genome control the effective population size of two RNA viruses at inoculation. XVIth EUCARPIA Capsicum and Eggplant Working Group Meeting, Kecskemét, Hungary. Communication orale.

2016 Impact of selection, genetic drift and viral accumulation on the evolution of a plant RNA virus. 13th International Plant Virus Epidemiology Symposium (IPVE), Avignon, France. Communication orale.

2016 Quantitative trait loci in pepper genome control PVY and CMV effective population sizes at inoculation. Réunion annuelle des doctorants du département Biologie et Amélioration des Plantes (BAP, INRAE), Lyon, France. Poster.

2015 Differential selection and genetic drift effects imposed by pepper genotypes on a composite virus population. Réunion annuelle des doctorants du département Santé des Plantes et Environnement (SPE, INRAE), Rennes, France. Communication orale.

Publications :

https://scholar.google.com/citations?hl=fr&user=JtfxH6YAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate