Mobiliser la diversité génétique pour étudier l’effet du type sexuel sur les caractères agronomiques chez le melon

Alors que la grande majorité des espèces à fleurs portent des fleurs hermaphrodites, les Cucurbitacées ont très généralement des sexes séparés, sur la même plante (monoécie) ou sur des plantes différentes (dioécie). Nous travaillons sur le melon, une espèce modèle pour l'étude du système reproducteur chez les plantes (Boualem et al. Science 2015). Nous avons démontré l'effet du type sexuel sur la forme des fruits (Boualem et al., Current Biology 2022). Dans ce stage, nous proposons d'étudier l'impact du type sexuel sur les performances agronomiques du melon et de contribuer à l'identification de nouveaux gènes du déterminisme du sexe chez les espèces apparentées sauvages de Cucurbitacées. 

Les objectifs du stage sont de :

- phénotyper les performances agronomiques de lignées quasi-isogéniques qui diffèrent pour le type sexuel dans un même fond génétique

- vérifier le génotype des plantes à l'aide de marqueurs moléculaires et déterminer l'impact des gènes du déterminisme de sexe sur le rendement des fruits et leur durée de conservation après récolte

- phénotyper le type sexuel dans une population en ségrégation, échantillonner des plantes pour extraction d’ADN et travaux futurs sur l’identification des gènes sous-jacents 

Les méthodes mises en œuvre sont :

- l’évaluation phénotypique de caractères agronomiques, la précocité, le rendement en fruits, la teneur en sucre des fruits et leur durée de conservation…

- le génotypage des plantes à l'aide de marqueurs moléculaires

- l'analyse statistique des données (méthodes de comparaison, analyse multivariée...).

Les résultats attendus sont

- l'identification des caractères impactés par les gènes du déterminisme du sexe chez le melon 

- les données de ségrégation de nouveaux gènes de déterminisme du sexe chez une espèce sauvage apparentée au melon

ACTIVITES DOMINANTES :

- phénotypage au champ ou sous tunnel et en laboratoire

- analyses statistiques

PROFIL REQUIS :

- Dernière année de Formation Supérieure BAC + 5

- Connaissances : Génétique, biologie florale

- Compétences opérationnelles : analyses statistiques sous R, rigueur des mesures phénotypiques 

- Goût pour la diversité génétique des plantes et le phénotypage

- Goût pour le travail sur le mode collaboratif

- Langues : Français, anglais

INDEMNISATION :

- environ 650 € / mois.

MAITRE DE STAGE et PERSONNE A CONTACTER : Catherine Dogimont, Directrice de Recherche INRAE, catherine.dogimont@inrae.fr

Adresse de stage : INRAE, Centre PACA, UR 1052, Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), Domaine St Maurice, 67, allée des Chênes CS 60094, 84143 Montfavet cedex

Durée 6 mois, dates flexibles

Références :

Boualem et al., 2022. Ethylene plays a dual role in sex determination and fruit shape in cucurbits. Current Biology, 32 : 2390-2401.e4. DOI: 10.1016/j.cub.2022.04.031.

Boualem et al,. 2015. A cucurbit androecy gene reveals how unisexual flowers develop and dioecy emerges. Science 350: 688-691. DOI10.1126/science.aac8370.